尝试使用shortRead包和readFastq函数读取解压缩的FASTQ文件

时间:2019-07-09 17:17:58

标签: r bioinformatics bioconductor fastq

我正在尝试使用以下功能读取fastq文件:

library("ShortRead") #Bioconductor

readFastq('C://Users//Durdona//Documents//BAL_1_S3_L001_I1_001', pattern=character(0))

但是它显示以下输出:

Error: Input/Output
no input files found
dirPath: C://Users//Durdona//Documents//BAL_1_S3_L001_I1_001
pattern: character(0)

我仔细检查了路径,试图移动文件并更改目录路径,还是一样。我该如何阅读FAST Q文件以查看输出?

0 个答案:

没有答案