UpSetR软件包缺少功能

时间:2019-03-01 09:41:27

标签: r

您好,我正在尝试重现UpSetR包的一些示例。但是,似乎缺少功能make_comb_mat

library(UpSetR)
library(circlize)
library(GenomicRanges)
lt2 = lapply(1:4, function(i) generateRandomBed())
lt2 = lapply(lt2, function(df) GRanges(seqnames = df[, 1], 
    ranges = IRanges(df[, 2], df[, 3])))
names(lt2) = letters[1:4]
m = make_comb_mat(lt2)
set_size(m)
  

make_comb_mat(lt2)中的错误:找不到函数“ make_comb_mat”   set_size(m)错误:找不到函数“ set_size”

我什至尝试指定软件包都没有成功:

UpSetR::make_comb_mat(lt2)
  

错误:“ make_comb_mat”不是从中导出的对象   'namespace:UpSetR'

此功能是否在UpSetR插图(https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/upset-plot.html)中未提及的其他软件包中实现?

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