您好,我正在尝试重现UpSetR
包的一些示例。但是,似乎缺少功能make_comb_mat
。
library(UpSetR)
library(circlize)
library(GenomicRanges)
lt2 = lapply(1:4, function(i) generateRandomBed())
lt2 = lapply(lt2, function(df) GRanges(seqnames = df[, 1],
ranges = IRanges(df[, 2], df[, 3])))
names(lt2) = letters[1:4]
m = make_comb_mat(lt2)
set_size(m)
make_comb_mat(lt2)中的错误:找不到函数“ make_comb_mat” set_size(m)错误:找不到函数“ set_size”
我什至尝试指定软件包都没有成功:
UpSetR::make_comb_mat(lt2)
错误:“ make_comb_mat”不是从中导出的对象 'namespace:UpSetR'
此功能是否在UpSetR
插图(https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/upset-plot.html)中未提及的其他软件包中实现?