xarray按多维数据切片数据

时间:2018-11-07 17:35:36

标签: multidimensional-array slice python-xarray

我正在使用GFS的预测数据。我编写了以下函数以从预测档案中提取时间序列:

def time_series_from_ensemble_archive(ensemble_archive, lead_time: int=0, ensemble_member: int=0):

    data = ensemble_archive

    data['age'] = (data.validityDateTime - data.as_of_datetime).astype(np.float)
    age_idx =  data['age']==lead_time

    return data[:, ensemble_member, :, :, :].values[age_idx.T, :, :]

它按预期工作:

这里是data

Coordinates:
  * validityDateTime    (validityDateTime) datetime64[ns] 2017-10-01 ...
  * perturbationNumber  (perturbationNumber) int32 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 ...
  * lon                 (lon) float64 -119.0 -118.5 -118.0 -117.5 -117.0 ...
  * lat                 (lat) float64 45.5 45.0 44.5 44.0 43.5 43.0 42.5 ...
  * as_of_datetime      (as_of_datetime) datetime64[ns] 2017-10-01 ...
Attributes:
    name:                 2 metre temperature

使用我的功能

temp_ts = time_series_from_ensemble_archive(data)
temp_ts.shape
(124, 10, 20)

type(temp_ts)
numpy.ndarray

但是,我觉得这不是最“ pythonic”或“ xarrayic”的方法,最好返回另一个xarray对象。这里有改进建议吗?有人可以使用expand_dims或.sel方法提供解决方案吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

xarray提供了多种index and select data的方式。您可以尝试indexing with dimension names,例如:

# select using positional & boolean indices
return data[{
    'perturbationNumber': ensemble_member,
    'validityDateTime': (data['age'] == lead_time)}]

或者如果lead_time实际上是位置索引,则

# select using positional indices
return data[{
    'perturbationNumber': ensemble_member,
    'validityDateTime': lead_time}]

如果您想提供索引标签而不是它们的位置,则可以使用.sel.loc方法:

# select using labels
return data.sel(
    perturbationNumber=ensemble_member,
    validityDateTime=lead_time)

# select using labels and boolean indices
return data.loc[{
    'perturbationNumber': ensemble_member,
    'validityDateTime': (data['age'] == lead_time)}]

调用da.values是返回xarray数据的numpy数组后端的步骤。没有理由为什么您的代码不应该与提供的索引一起为实际的xarray DataArray(没有.values建立索引)。