使用ggraph绘制双字母组共现时出现问题，某些行未显示

Question

我正在尝试绘制双字母组（来自Text Mining with R）的同现，如下所示：

或者像这样：

但是按照书中给出的完全相同的代码，我的绘图缺少许多线条和颜色。不知道是因为我错过了一些重要步骤还是缺少某些软件包。

以下是用于说明的简单版本：

library(dplyr)
library(ggplot2)
library(igraph)
library(ggraph)

terms <- sample(letters[1:10],50,replace=T)
count <- sample(1:50,25,replace=T)

bigrams <- data_frame(term1=terms[1:25],term2=terms[26:50],occur=count) %>%
  arrange(desc(occur)) %>%
  graph_from_data_frame()

a <- grid::arrow(type = "closed", length = unit(.15, "inches"))

我得到的图不正确（甚至图例未正确显示）：

ggraph(bigrams, layout = "fr") +
  geom_edge_link(aes(edge_alpha = occur), show.legend = FALSE,  
                 arrow = a, end_cap = circle(.07, 'inches')) +
  geom_node_point(color = "lightblue", size = 5) +
  geom_node_text(aes(label = name), vjust = 1, hjust = 1) +
  theme_void()

ggraph(bigrams, layout = "fr") +
  geom_edge_link(aes(edge_alpha = occur, edge_width = occur), edge_colour = "cyan4") +
  geom_node_point(size = 5) +
  geom_node_text(aes(label = name), repel = TRUE, 
                 point.padding = unit(0.2, "lines")) +
  theme_void()

好吧，这很有趣，但是删除theme_void()可以解决所有问题。我想这本书写的时候会有所不同。但是，第二张图中的图例仍未显示，因此仍然存在错误：

Answer 1

我发现ggraph软件包不错，但存在一些问题。对我来说，如果您在RStudio中放大绘图，代码就可以工作。
但是，我建议您使用一些小的mod，使其在不缩放的情况下进行绘制：

ggraph(bigrams, layout = "fr") +
  geom_edge_link(aes(width = occur),          # seems the alpha creates problem with legend
                 colour = "cyan4") +
  geom_node_point(size = 5) +
  scale_edge_width(range = c(0.2, 2)) +       # rescale the edges
  geom_node_text(aes(label = name), repel = TRUE, point.padding = unit(0.2, "lines"))+
 theme_graph()                                # made for graph

如果您想要Alpha，可以尝试一下，但是我注意到您仅在RStudio中看到图例：

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数据与您相同，但使用set.seed(1)。