通过MPI发送复数时的MPI_ERR_TRUNCATE [MPI4py]

时间:2018-05-22 01:16:13

标签: python buffer mpi complex-numbers mpi4py

我正在尝试使用MPI(MPI4py)的Python实现从单个发送方向单个接收方发送单个复数。这是代码:

from mpi4py import MPI
import numpy as np

comm = MPI.COMM_WORLD

if comm.rank == 0:

    print("I am sender")

    a = np.matrix('5+1j')

    req = [None]
    #Send message with a predefined tag, like 15, to rank 1
    req = comm.Isend([a, MPI.COMPLEX], dest=1, tag=15)

    MPI.Request.Wait(req)

    print("Sender sent:  ")
    print(a[0])

else:

    print("I am receiver")

    A = np.empty_like(np.matrix([[0]*(1) for i in range(1)]))

    print("point 1")

    #Receive message with tag 15 from rank 0
    rA = comm.Irecv(A, source=0, tag=15)

    rA.wait()

    print("Receiver received:  ")
    print(A)

请注意,上面的示例是我的目标的简化版本,即从一个发件人向多个接收者发送许多复杂条目的numpy数组(或numpy矩阵)。这就是为什么我在此示例中使用非阻止发送Comm::Isend()和接收Comm::Irecv()以及Request::Wait()的原因。但是一般来说,对于for循环,每次迭代我会有一个Comm::Isend(),对于一个请求向量,我会有Request::Waitall(),一般来说每个接收器一个。

对于上述程序,创建的MPI进程只有两个,一个发送者和一个接收者。我的MPI4py安装也是3.0.0。并使用Python 2.7.14和Open MPI 2.1.2的内核。

现在,程序崩溃了

rA.wait()

出现以下错误

  

mpi4py.MPI.Exception:MPI_ERR_TRUNCATE:消息被截断

基于在线搜索的

意味着接收者的缓冲区不足以存储接收的数据,即复数,但我不明白为什么。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

以下是幕后发生的事情:

  • MPI_Isend(..., datatype=MPI_COMPLEX, ...)
  • MPI_Irecv(..., datatype=MPI_LONG, ...)

所以问题来自你初始化接收缓冲区的方式

A = np.empty_like(np.matrix([[0]*(1) for i in range(1)]))

可能的修复

A = np.empty(shape(1,1), dtype=complex)

A = np.matrix('-1-1j')

为了将A定义为复杂的矩阵