我正在尝试使用nls2
包查找参数。由于我试图优化参数的公式非常复杂,我尝试使用我在nls2
命令优化的公式中调用的函数:
library(nls2)
set.seed(20160227)
x <- seq(0,50,1)
y <- ((runif(1,10,20)*x)/(runif(1,0,10)+x))+rnorm(51,0,1)
a <- function(){
d+1
}
f1 <- function(){
y <- a()*x/(b+x)
}
st <- data.frame(d = c(-100,100),
b = c(-100,100))
nls2(f1,start = st, algorithm = "brute-force")
目前,这会引发错误
错误:类型&#39;关闭的对象&#39;不是子集表格
我发现此错误here,但是当我将值分配给b
和d
时,这有效:
a()*x/(b+x)
我认为问题在于我尝试使用内置函数找到b
和d
?
最好的方法是什么?它是否可能,或者我是否需要在nls2
中定义整个复杂公式?
答案 0 :(得分:1)
此处f1
和a
都没有任何参数,因此在理解您希望优化f1
的方式时遇到一些困难并不令人惊讶。
nls2::nls2
(如stats::nls
)期望formula
作为第一个参数。该公式可以根据您想要的任何函数构建,并且不必在调用中完全写下来。您可以执行以下操作:
a <- function(d){
d+1
}
f1 <- function(b,d,x){
y <- a(d)*x/(b+x)
}
然后适合这样的模型:
nls2(y~f1(b,d,x), start = st, algorithm = "brute-force")
由于没有为start
提供x
值,并且因为它的实际值可以在环境中找到,所以它不会优于x
,只有{{1} }和b
。