在R中写入CSV时,追加功能不起作用

时间:2018-05-04 16:20:24

标签: r

我有以下R脚本:

target <- c("Autocorrelation","InformationContent_zero","InformationContent_one","InformationContent_two",
            "InformationContent_four","PartialIC_zero","PartialIC_one","PartialIC_two","PartialIC_four",
            "DBI_zero","DBI_one","DBI_two","DBI_four")

for (tar in target){
  AC_data <- subset(data, select=c(tar))
  AC <- aggregate(AC_data , list(class=data$TARGET_CLASS), mean)
  ordered_AC <- AC[order(-AC[tar]),]
  write.csv(ordered_AC,file="/home/nasser/Desktop/Experiments/evosuite-report/finalData.csv",append=TRUE)
}

当我使用我处理的数据运行脚本时,我得到以下结果:

                    class Autocorrelation
16    SomeExternalClass11      0.26582445
3     MoreMethodsModified      0.21295785
10  MultiPlateauxModified      0.19942221
1             DoublePeaks      0.19534564
                    class InformationContent_zero
2             MoreMethods              0.17936452
7              MultiPeaks              0.13527150
12 NeedleInHaystackNoParm              0.11714634
6    MultiMethodsModified              0.07180512
                    class InformationContent_one
2             MoreMethods             0.17936452
7              MultiPeaks             0.13527150
12 NeedleInHaystackNoParm             0.11714634
6    MultiMethodsModified             0.07180512

问题是写入CSV文件的唯一数据是最后一组class InformationContent_one

这意味着前两组被覆盖。您知道如何解决此问题并将所有数据写入CSV文件吗?

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

write.table的帮助中,它声明:

  

write.csv和write.csv2为写入CSV提供了便利包装   文件。

     

...

     

这些包装是故意不灵活的:它们是   旨在确保使用正确的约定来编写   有效档案。尝试更改append,col.names,sep,dec或qmethod   被忽略,并发出警告。

如果要追加,则需要明确使用write.table

答案 1 :(得分:1)

R中的惯用方法是rbind您的数据框并写一次:

write.csv(
  do.call(rbind, lapply(target, function(tar) {
    AC_data <- subset(data, select = c(tar))
    AC <- aggregate(AC_data , list(class = data$TARGET_CLASS), mean)
    res <- AC[order(-AC[tar]),]
    res$var <- names(res)[2]
    names(res)[2] <- "value"
    res
  })),
  file = "/home/nasser/Desktop/Experiments/evosuite-report/finalData.csv"
)