我在训练数据上使用scikit-learn NMF模型拟合模型。现在我使用
执行新数据的逆变换result_1 = model.inverse_transform(model.transform(new_data))
然后我使用幻灯片15 here中的等式手动从NMF模型中获取组件来计算我的数据的逆变换。
temp = np.dot(model.components_, model.components_.T)
transform = np.dot(np.dot(model.components_.T, np.linalg.pinv(temp)),
model.components_)
result_2 = np.dot(new_data, transform)
我想了解为什么2个结果不匹配。 在计算逆变换和重建数据时我做错了什么?
示例代码:
import numpy as np
from sklearn.decomposition import NMF
data = np.array([[0,0,1,1,1],[0,1,1,0,0],[0,1,0,0,0],[1,0,0,1,0]])
print(data)
//array([[0, 0, 1, 1, 1],
[0, 1, 1, 0, 0],
[0, 1, 0, 0, 0],
[1, 0, 0, 1, 0]])
model = NMF(alpha=0.0, init='random', l1_ratio=0.0, max_iter=200, n_components=2, random_state=0, shuffle=False, solver='cd', tol=0.0001, verbose=0)
model.fit(data)
NMF(alpha=0.0, beta_loss='frobenius', init='random', l1_ratio=0.0,
max_iter=200, n_components=2, random_state=0, shuffle=False, solver='cd',
tol=0.0001, verbose=0)
new_data = np.array([[0,0,1,0,0], [1,0,0,0,0]])
print(new_data)
//array([[0, 0, 1, 0, 0],
[1, 0, 0, 0, 0]])
result_1 = model.inverse_transform(model.transform(new_data))
print(result_1)
//array([[ 0.09232497, 0.38903892, 0.36668712, 0.23067627, 0.1383513 ],
[ 0.0877082 , 0. , 0.12131779, 0.21914115, 0.13143295]])
temp = np.dot(model.components_, model.components_.T)
transform = np.dot(np.dot(model.components_.T, np.linalg.pinv(temp)), model.components_)
result_2 = np.dot(new_data, transform)
print(result_2)
//array([[ 0.09232484, 0.389039 , 0.36668699, 0.23067595, 0.13835111],
[ 0.09193481, -0.05671439, 0.09232484, 0.22970145, 0.13776664]])
注意:虽然这不是描述我的问题的最佳数据,但代码基本相同。在实际案例中,result_1
和result_2
彼此之间的差别也更大。 data
和new_data
也是大数组。
答案 0 :(得分:1)
在scikit-learn中,NMF不仅仅是简单的矩阵乘法:它优化!
解码(inverse_transform
)是线性的:模型计算X_decoded = dot(W, H)
,其中W
是编码矩阵,H=model.components_
是模型参数的学习矩阵。
然而,编码(transform
)非线性:它执行W = argmin(loss(X_original, H, W))
(仅针对W
),其中损失是均方误差X_original
和dot(W, H)
,加上一些额外的惩罚(W
的L1和L2规范),以及W
必须为非负数的约束。最小化由坐标下降执行,结果在X_original
中可能是非线性的。因此,您不能简单地通过乘以矩阵来获得W
。
NMF必须执行这种奇怪的计算,否则,该模型可能会产生负面结果。实际上,在您自己的示例中,您可以尝试通过矩阵乘法执行变换
print(np.dot(new_data, np.dot(model.components_.T, np.linalg.pinv(temp))))
并获得包含负数的结果W
:
[[ 0.17328927 0.39649966]
[ 0.1725572 -0.05780202]]
然而,NMF中的坐标下降通过稍微修改矩阵来避免这个问题:
print(model.transform(new_data))
给出非负结果
[[0.17328951 0.39649958]
[0.16462405 0. ]]
你可以看到它不是简单地从下面剪切W
矩阵,而是修改正元素,以便改善拟合(并遵守正则化惩罚)。