Question

我正在尝试使用R的 gganimate 包来创建一组直方图的动画，其中动画的每个帧都显示图像的直方图。我有~400张图片，所以~400列。我的数据如下：

| bins.left | bins.right | hist1 | hist 2 | ... | hist n |

如您所见，我需要将每列视为每帧中直方图的Y值。换句话说，我的动画应该迭代列。

但是我在互联网上研究过的所有例子似乎都只考虑一列作为帧的标识符。例如在this example中：

mapping <- aes(x = gdpPercap, y = lifeExp, 
           size = pop, color = continent,
           frame = year) 
p <- ggplot(gapminder, mapping = mapping) +
  geom_point() +
  scale_x_log10()

属性' Year '被视为迭代器。这些数据如下所示：

  country continent  year lifeExp      pop gdpPercap
   <fctr>    <fctr> <int>   <dbl>    <int>     <dbl>
1 Afghanistan      Asia  1952  28.801  8425333  779.4453
2 Afghanistan      Asia  1957  30.332  9240934  820.8530
3 Afghanistan      Asia  1962  31.997 10267083  853.1007
4 Afghanistan      Asia  1967  34.020 11537966  836.1971
5 Afghanistan      Asia  1972  36.088 13079460  739.9811
6 Afghanistan      Asia  1977  38.438 14880372  786.1134

我不想修改我的数据以适应这种模式的原因是，如果我将所有直方图保存在一列中，我的数据框将非常冗长（长度= ~16000 * 400）并且很难处理。此外，以一种令人困惑的方式保持我的数据并不直观。我相信我的问题必须有一个简单的解决方案。任何建议都受到高度赞赏。

Answer 1

正如@Marius所说，如果你的数据是长格式的，你可以使这个工作。下面我创建一些假数据，然后制作动画情节。

library(tidyverse)
theme_set(theme_classic())
library(gganimate)

这里有10列值的假数据，我们想要变成直方图。

set.seed(2)
dat = replicate(10, runif(100)) %>% as.data.frame

数据采用宽屏格式，因此我们首先使用gather函数将其转换为长格式：

d = dat %>% gather(key, value)

在新的长格式中，key列告诉我们数据最初来自哪个直方图列。我们将其用作frame并运行geom_histogram：

p = ggplot(d, aes(value, frame=key)) +
  geom_histogram() 

gganimate(p)

你可以看到这不是我们想要的。 ggplot实际上从所有数据生成了一个直方图，动画只是连续显示每个堆栈中来自key的每个值的部分。

我们需要一种方法来让ggplot创建单独的直方图并为它们设置动画。我们可以通过预先分箱数据并使用geom_rect创建直方图条来实现这一点：

d = dat %>% gather(key, value) %>% 
  mutate(bins = cut(value, breaks=seq(0,1,0.1), 
                    labels=seq(0,0.9,0.1) + 0.05, include.lowest=TRUE),
         bins = as.numeric(as.character(bins))) %>% 
  group_by(key, bins) %>% 
  tally

p = ggplot(d, aes(xmin=bins - 0.048, xmax=bins + 0.048, ymin=0, ymax=n, frame=key)) +
  geom_rect() +
  scale_y_continuous(limits=c(0, max(d$n)))

gganimate(p)

在回复您的评论时，我认为您不能使用gganimate广泛的数据。 gganimate需要一个frame列，需要长格式的数据。但是，gganimate是animation包的包装，您可以使用for循环和saveGIF函数直接创建动画GIF文件：

library(animation)

saveGIF({
  for (i in names(dat)) {
    p = ggplot(dat, aes_string(i)) +
      geom_histogram(breaks=seq(0,1,0.1))
    print(p)
  }
}, movie.name="test.gif")

如何在gganimate包（R）中使用多个列作为动画的帧？

1 个答案: