我已将以下玩具化学反应转化为DataFrame以进一步进行二分网络表示:
R1: A + B -> C
R2: C + D -> E
SourceTarget
R1 C
A R1
B R1
R2 E
C R2
D R2
现在,我想从这个创建一个新的DataFrame,仅代表基于其化合物的反应之间的关系,例如:
在C
以上的DataFrame中,来自R1
的目标和C
的{{1}}的来源,然后,关系应该是:
R2
(我可以为上面的Daframe获得的唯一反应 - 反应关系)
我为此任务创建的代码如下:
R1->R2
然而,代码适用于大表(数千行),它变得非常慢......我还是初学者,所以如果你能帮助我改进它,我会很高兴。谢谢= D
答案 0 :(得分:1)
我的偏好是基于字典的方法:
import pandas as pd
d = df.set_index('Source')['Target']
r = {i for i in set(df['Source']).union(df['Target']) if 'R' in i}
{k: d.get(d.get(k)) for k in r if d.get(d.get(k))}
# {'R1': 'R2'}
答案 1 :(得分:1)
您可以合并日期框架上的数据框
RtoC = df.merge(df,how='inner',left_on='Source',right_on='Target')\
.drop(['Target_y','Source_x'],axis=1)\
.rename(columns={'Target_x':'Target','Source_y':'Source'})
然后过滤化合物
RtoC[(RtoC.Target.str.contains('\d()')) & (RtoC.Source.str.contains('\d()'))]
Target Source
4 R2 R1
或转换为字典,映射值并过滤
mapper = dict(df.values[::-1])
df.Target = df.Target.map(mapper)
df[(df.Target.str.contains('\d()')) & (df.Source.str.contains('\d()'))]
Source Target
0 R1 R2