我有一个数据框df
:
df = pd.DataFrame({'id1':[1,1,1,1,1,4,4,4,6,6],
'id2':[45,45,33,33,33,1,1,1,34,34],
'vals':[0.1,0.2,0.6,0.1,0.15,0.34,0.12,0.5,0.4,0.45],
'date':pd.to_datetime(['2017-01-01','2017-01-02','2017-01-01',
'2017-04-01','2017-04-02','2017-01-01',
'2017-01-02','2017-01-03','2017-01-04',
'2017-01-05'])})
我想根据每组id1
和id2
的时间创建滞后期限。例如,t_1
将是前一天的值。 t_2
将是前两天的价值。如果两天前没有价值,我希望它是nan
。这将是上述数据帧的输出:
date id1 id2 vals t_1 t_2
0 2017-01-01 1 33 0.60 NaN NaN
1 2017-04-01 1 33 0.10 NaN NaN
2 2017-04-02 1 33 0.15 0.10 NaN
0 2017-01-01 1 45 0.10 NaN NaN
1 2017-01-02 1 45 0.20 0.10 NaN
0 2017-01-01 4 1 0.34 NaN NaN
1 2017-01-02 4 1 0.12 0.34 NaN
2 2017-01-03 4 1 0.50 0.12 0.34
0 2017-01-04 6 34 0.40 NaN NaN
1 2017-01-05 6 34 0.45 0.40 NaN
我可以通过使用下面的代码来实现这一点,但对于大量的群体来说效率非常低 - 即如果我有{x 1}}和id1
的10000 x 500个唯一组合,那么几天每个数据,我想要2个滞后项,需要长时间。
id2
有更有效的方法吗?
答案 0 :(得分:4)
通过组合使用unstack分配组并将其移位以避免使用apply,从而获得极大的加速。
def compute_shift(df):
df['group_no'] = df.groupby(['id1','id2']).ngroup()
tmp = df[['date','vals','group_no']].set_index(['group_no','date'])\
.unstack('group_no')\
.resample('D').asfreq()
tmp1 = tmp.shift(1).stack('group_no')['vals'].rename('t_1')
tmp2 = tmp.shift(2).stack('group_no')['vals'].rename('t_2')
df = df.join(tmp1, on=['date','group_no'])
df = df.join(tmp2, on=['date','group_no'])
return df
compute_shift(df)
date id1 id2 vals group_no t_1 t_2
0 2017-01-01 1 45 0.10 1 NaN NaN
1 2017-01-02 1 45 0.20 1 0.10 NaN
2 2017-01-01 1 33 0.60 0 NaN NaN
3 2017-04-01 1 33 0.10 0 NaN NaN
4 2017-04-02 1 33 0.15 0 0.10 NaN
5 2017-01-01 4 1 0.34 2 NaN NaN
6 2017-01-02 4 1 0.12 2 0.34 NaN
7 2017-01-03 4 1 0.50 2 0.12 0.34
8 2017-01-04 6 34 0.40 3 NaN NaN
9 2017-01-05 6 34 0.45 3 0.40 NaN
为了比较性能,我创建了一个合理大小的假数据集:
df = pd.DataFrame({'date':np.random.randint(1, 1000, 10**6),
'id1':np.random.randint(1, 100, 10**6),
'id2':np.random.randint(1, 100, 10**6),
'vals':np.random.random(10**6)})
df = df.drop_duplicates(subset=['date','id1','id2'], keep='last')
df = df.sort_values('date')
dates = pd.date_range('20150101','20180101').to_series().reset_index(drop=True)
df['date'] = df['date'].map(dates)
如果我们将性能与温和斯科特的解决方案进行比较:
%timeit df.groupby(['id1','id2'],sort=False).apply(lambda x : x['vals'].shift()*((x['date'] - pd.to_timedelta(1, unit='d')).isin(x['date'].tolist())).replace(False,np.nan))
824 ms ± 19.3 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
%timeit df.groupby(['id1','id2'], as_index=False)\
.apply(lambda x: x.assign(t_1=x.vals.resample('D').asfreq().shift(1),\
t_2=x.vals.resample('D').asfreq().shift(2)))
1.38 s ± 25.3 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)
%timeit compute_shift(df)
96.4 ms ± 2.14 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)
如果您的DataFrame不是那么大,我可能更喜欢Scott Bostons解决方案,因为它感觉更干净但是如果运行时是一个问题,那么unstack + shift + join会更快。
编辑:添加了重新采样以填补缺失的日期。
答案 1 :(得分:2)
使用apply
...
SHIFT1
df.groupby(['id1','id2'],sort=False).apply(lambda x : x['vals'].shift()*((x['date'] - pd.to_timedelta(1, unit='d')).isin(x['date'].tolist())).replace(False,np.nan))
Out[775]:
id1 id2
1 45 0 NaN
1 0.10
33 2 NaN
3 NaN
4 0.10
4 1 5 NaN
6 0.34
7 0.12
6 34 8 NaN
9 0.40
dtype: float64
SHIFT2
df.groupby(['id1','id2'],sort=False).apply(lambda x : x['vals'].shift(2)*((x['date'] - pd.to_timedelta(2, unit='d')).isin(x['date'].tolist())).replace(False,np.nan))
Out[776]:
id1 id2
1 45 0 NaN
1 NaN
33 2 NaN
3 NaN
4 NaN
4 1 5 NaN
6 NaN
7 0.34
6 34 8 NaN
9 NaN
dtype: float64
答案 2 :(得分:2)
您可以使用set_index
,resample
和shift
尝试此操作:
df1 = df.set_index('date')
df1.groupby(['id1','id2'], as_index=False)\
.apply(lambda x: x.assign(t_1=x.vals.resample('D').asfreq().shift(1),
t_2=x.vals.resample('D').asfreq().shift(2)))
输出:
id1 id2 vals t_1 t_2
date
0 2017-01-01 1 33 0.60 NaN NaN
2017-04-01 1 33 0.10 NaN NaN
2017-04-02 1 33 0.15 0.10 NaN
1 2017-01-01 1 45 0.10 NaN NaN
2017-01-02 1 45 0.20 0.10 NaN
2 2017-01-01 4 1 0.34 NaN NaN
2017-01-02 4 1 0.12 0.34 NaN
2017-01-03 4 1 0.50 0.12 0.34
3 2017-01-04 6 34 0.40 NaN NaN
2017-01-05 6 34 0.45 0.40 NaN
答案 3 :(得分:0)
您可以尝试多索引和合并
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