Question

我有一个字符串

ATOM   2448  N   LEU   301      -6.821  36.580  65.884  1.00 19.70           O

在这里，我需要用NHE替换第三列中的任何术语（总是等于树大写字母）。

我尝试使用

sed-e 's/[[:upper:]][[:upper:]][[:upper:]]/NHE/g'

但它也取代了第一栏中的世界

NHEM   2448  N   NHE   301      -6.821  36.580  65.884  1.00 19.70           O

如何让sed只替换只包含3个字母（不超过3个）的单词？

谢谢！

Answer 1

这可能适合你（GNU sed）：

sed 's/\S\+/NHE/4' file

将第4个非空列替换为NHE

替代方案：

sed 's/\S\S*/NHE/4' file

Answer 2

sed -r 's/(([^[:blank:]]+[[:blank:]]+){3})\<[[:upper:]]{3}\>/\1NHE/' file

ATOM   2448  N   NHE   301      -6.821  36.580  65.884  1.00 19.70           O

有些系统需要-E而不是-r

使用GNU sed，您可以指定替换哪个匹配。在这里，您想要替换第4个以空格分隔的单词：

sed -r 's/[^[:blank:]]+/NHE/4' file