使用command_line_arguments将R脚本提交到PBS HPC群集

Question

请你告诉我以下内容：我写了一个R脚本，从命令行读取3个参数，即：

args <- commandArgs(TRUE)
TUMOR <- args[1]       
GERMLINE <- args[2]
CHR <- args[3]

当我将R脚本提交给PBS HPC调度程序时，我执行以下操作（下面），但是......我收到一条错误消息。 （我没有发布错误消息，因为我写的R脚本在从常规终端运行时工作正常..）

请问，您如何通常使用命令行参数向PBS HPC调度程序提交R脚本？

qsub -d $PWD -l nodes=1:ppn=4 -l vmem=10gb -m bea -M tanasa@gmail.com \
-v TUMOR="tumor.bam",GERMLINE="germline.bam",CHR="chr22" \
-e script.efile.chr22 \
-o script.ofile.chr22 \
 script.R