想要摆脱循环的建议

时间:2010-12-18 20:38:44

标签: r loops vectorization

我编写了一个程序,该程序适用于3n + 1问题(又名“奇妙数字”和其他各种事物)。但它有一个双循环。我怎么能把它矢量化呢?

代码是

count <- vector("numeric", 100000)
L <- length(count)

for (i in 1:L)
{
x <- i
   while (x > 1)
   {
   if (round(x/2) == x/2) 
     {
     x <- x/2
     count[i] <- count[i] + 1 
     } else
     {
     x <- 3*x + 1
     count[i] <- count[i] + 1
     }
   }
}

谢谢!

3 个答案:

答案 0 :(得分:9)

我通过创建向量x将其转换为“由内向外”,其中第i个元素是算法每次迭代后的值。结果相对容易理解为

f1 <- function(L) {
    x <- seq_len(L)
    count <- integer(L)
    while (any(i <- x > 1)) {
        count[i] <- count[i] + 1L
        x <- ifelse(round(x/2) == x/2, x / 2, 3 * x + 1) * i
    }
    count
}

这可以优化为(a)仅跟踪仍在播放的那些值(通过idx)和(b)避免不必要的操作,例如,ifelse为x的所有值评估两个参数,x / 2评估两次。

f2 <- function(L) {
    idx <- x <- seq_len(L)
    count <- integer(L)
    while (length(x)) {
        ix <- x > 1
        x <- x[ix]
        idx <- idx[ix]
        count[idx] <- count[idx] + 1L
        i <- as.logical(x %% 2)
        x[i] <- 3 * x[i] + 1
        i <- !i
        x[i] <- x[i] / 2
    }
    count
}

用f0原始函数,我有

> L <- 10000
> system.time(ans0 <- f0(L))
   user  system elapsed 
  7.785   0.000   7.812 
> system.time(ans1 <- f1(L))
   user  system elapsed 
  1.738   0.000   1.741 
> identical(ans0, ans1)
[1] TRUE
> system.time(ans2 <- f2(L))
   user  system elapsed 
  0.301   0.000   0.301 
> identical(ans1, ans2)
[1] TRUE

调整是将奇数值更新为3 * x [i] + 1,然后无条件地将除数除以

x[i] <- 3 * x[i] + 1
count[idx[i]] <- count[idx[i]] + 1L
x <- x / 2
count[idx] <- count[idx] + 1

这是f3(不知道为什么f2今天早上比较慢!)我得到了

> system.time(ans2 <- f2(L))
   user  system elapsed 
   0.36    0.00    0.36 
> system.time(ans3 <- f3(L))
   user  system elapsed 
  0.201   0.003   0.206 
> identical(ans2, ans3)
[1] TRUE

似乎可以在二分之二阶段采取更大的步骤,例如,8是2 ^ 3,所以我们可以采取3步(加3计数)并完成,20是2 ^ 2 * 5所以我们可以采取两个步骤并进入下一次迭代5.实现?

答案 1 :(得分:4)

因为您需要迭代x的值,所以您无法真正对此进行矢量化。在某些时候,R必须分别依次处理x的每个值。您可以在单独的CPU内核上运行计算以加快速度,可能使用同名包中的foreach

否则,(这只是隐藏你的循环),将循环的主体包裹为一个函数,例如:

wonderous <- function(n) {
    count <- 0
    while(n > 1) {
        if(isTRUE(all.equal(n %% 2, 0))) {
            n <- n / 2
        } else {
            n <- (3*n) + 1
        }
        count <- count + 1
    }
    return(count)
}

然后您可以使用sapply()在一组数字上运行该函数:

> sapply(1:50, wonderous)
 [1]   0   1   7   2   5   8  16   3  19   6  14   9   9  17  17
[16]   4  12  20  20   7   7  15  15  10  23  10 111  18  18  18
[31] 106   5  26  13  13  21  21  21  34   8 109   8  29  16  16
[46]  16 104  11  24  24

或者您可以使用Vectorize返回wonderous的矢量化版本,这个版本本身就是一个隐藏更多内容的函数:

> wonderousV <- Vectorize(wonderous)
> wonderousV(1:50)
 [1]   0   1   7   2   5   8  16   3  19   6  14   9   9  17  17
[16]   4  12  20  20   7   7  15  15  10  23  10 111  18  18  18
[31] 106   5  26  13  13  21  21  21  34   8 109   8  29  16  16
[46]  16 104  11  24  24

我认为目前你可以使用标准的R工具。 @Martin Morgan表明你可以做得比这更好,巧妙地解决了这个问题。 确实使用了R的矢量化技能。

答案 2 :(得分:2)

一种不同的方法可以识别出一个经常重新访问低数字的方法,那么为什么不记住它们并节省重新计算成本呢?

memo_f <- function() {
    e <- new.env(parent=emptyenv())
    e[["1"]] <- 0L
    f <- function(x) {
        k <- as.character(x)
        if (!exists(k, envir=e))
            e[[k]] <- 1L + if (x %% 2) f(3L * x + 1L) else f(x / 2L)
        e[[k]]
    }
    f
}

给出了

> L <- 100
> vals <- seq_len(L)
> system.time({ f <- memo_f(); memo1 <- sapply(vals, f) })
   user  system elapsed 
  0.018   0.000   0.019 
> system.time(won <- sapply(vals, wonderous))
   user  system elapsed 
  0.921   0.005   0.930 
> all.equal(memo1, won) ## integer vs. numeric
[1] TRUE

这可能不会很好地并行化,但那么50倍加速可能没有必要吗?递归也可能过于深入,但递归可以写成循环(无论如何都可能更快)。