Question

我正在尝试从python脚本执行以下awk命令

awk 'BEGIN {FS="\t"}; {print $1"\t"$2}' file_a > file_b

为此，我尝试使用subprocess，如下所示：

subprocess.check_output(["awk", 'BEGIN {FS="\t"}; {print $1"\t"$2}',
                         file_a, ">",
                         file_b])

其中file_a和file_b是指向文件路径的字符串。

由此，我收到错误

awk：无法打开＆gt; （没有这样的文件或目录）

我确定我以错误的方式输入subprocess的参数，但我无法弄清楚错误。

Answer 1

虽然它可能在您选择的shell中看起来像>，<和|实际上并未作为参数传递给您运行的程序。相反，它们是程序永远不会看到的shell的特殊部分。

由于它们是shell的一部分，而不是操作系统或程序的一部分，因此您必须使用语言为您提供的常规工具自己模拟其效果。在您的情况下，由于您正在尝试管道传输文件，只是像平常一样使用Python的open() 。 subprocess API支持指定stdout，stdin和stderr的参数，您可以为这些提供任何文件对象。

检查出来：

with open(file_b, 'wb') as f:
    subprocess.call(["awk", 'BEGIN {FS="\t"}; {print $1"\t"$2}', file_a], stdout=f)

由于subprocess.check_output已经重定向输出，因此不会使用stdout参数。使用subprocess.call可以避免这种情况。如果您稍后还需要在脚本中输出，则可以将check_output的返回值指定给变量，然后将其保存到file_b。

如果你使用了很多shell命令，你可能还想看看Plumbum，这会给你一大堆相当愚蠢的类似shell的运算符重载。

从python执行awk命令

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