Question

data.table fread（）有时会在读取制表符分隔或csv文件时崩溃我的R会话。这取决于输入文件确定性地发生。

> fread('C:/TEMP/single_cell_ia.txt', verbose = TRUE)
Input contains no \n. Taking this to be a filename to open
File opened, filesize is 0.000099 GB.
Memory mapping ... ok
Detected eol as \n only (no \r afterwards), the UNIX and Mac standard.
Positioned on line 1 after skip or autostart
This line is the autostart and not blank so searching up for the last non-blank ... line 1
Detecting sep ...

[R会话崩溃]

可以使用read.delim（）或read.csv（）读取带有fread（）问题的文件而不会出现问题。我已经使用制表符分隔文件执行了许多测试，并观察了以下内容：

问题解决了：

在Excel中打开（不做任何更改）并再次保存为制表符分隔的文本文件
使用Unix
使用搜索 - ＆gt;替换标题中不同长度的其他文字。查找 - ＆gt;在Windows下的Notepad ++中替换菜单

问题没解决：

制作文件的副本
在Notepad ++中打开（不做任何更改）和“另存为...”
使用Unix
使用搜索 - ＆gt;用相同长度的其他文本替换标题中的文字。查找 - ＆gt;在Windows下的Notepad ++中替换菜单

我无法创建一个小问题，在这里发布问题，但我很高兴发送我用于测试的文件（104 kB; 14行; 803列）

谢谢，斯特芬。

> sessionInfo()
R version 3.3.3 (2017-03-06)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1

locale:
[1] LC_COLLATE=English_Australia.1252  LC_CTYPE=English_Australia.1252    LC_MONETARY=English_Australia.1252
[4] LC_NUMERIC=C                       LC_TIME=English_Australia.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] data.table_1.10.4

loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.3.3

data.table fread（）有时会崩溃R会话

0 个答案: