Qsub导致脚本无效：＆＃34;命令未找到＆＃34;

Question

我正在运行一个脚本＆＃34; example.sh＆＃34;它接受5个命令行参数。

这很好用：

./example.sh arg1 arg2 arg3 arg4 arg5

并返回文件result1.txt

现在，当我尝试在SGE群集上运行它时（有或没有＆＃34; ./"）：

qsub ./example.sh arg1 arg2 arg3 arg4 arg5

这不会导致任何输出。

在example.sh.eXXXXXXX文件中，我得到：

arg1=1: Command not found.
arg2=2: Command not found.
...
and so on.

我不确定为什么它不适用于qsub命令。我还插了一个

#!/usr/bin/env bash

在我的脚本顶部。我已经调整了一段时间的东西，尝试了我在stackoverflow和web上找到的不同的东西，但到目前为止没有成功（我已经尝试了-S和-F标志）。任何建议都值得我指出正确的方向。

Answer 1

qsub无法接受您的shell脚本的论据，但其中任何一个都可以使用：

1）将./example.sh arg1 arg2 arg3 arg4 arg5放入另一个脚本，例如command.sh，然后运行qsub command.sh。

2）将您的完整命令作为标准输入传递到qsub，例如：echo ./example.sh arg1 arg2 arg3 arg4 arg5 | qsub。