n中的ntile和cut之间的差异然后是R中的quantile()函数

时间:2017-01-14 18:36:32

标签: r dplyr

我在这个主题上发现了两个用于计算R中十分位数的线程。但是,两个方法,即dplyr::ntilequantile()产生不同的输出。实际上,dplyr::ntile()无法输出正确的十分位数。

方法1:使用ntile()R: splitting dataset into quartiles/deciles. What is the right method?主题开始,我们可以使用ntile()

这是我的代码:

vector<-c(0.0242034679584454, 0.0240411606258083, 0.00519255930109344, 
  0.00948031338483081, 0.000549450549450549, 0.085972850678733, 
  0.00231687756193192, NA, 0.1131625967838, 0.00539244534707915, 
  0.0604885614579294, 0.0352030947775629, 0.00935626135385923, 
  0.401201201201201, 0.0208212839791787, NA, 0.0462887301644538, 
  0.0224952741020794, NA, NA, 0.000984952654008562)

ntile(vector,10)

输出结果为:

ntile(vector,10)
5  5  2  3  1  7  1 NA  8  2  7  6  3  8  4 NA  6  4 NA NA  1

如果我们分析一下,我们看到没有第10个分位数!

方法2:使用分位数() 现在,让我们使用How to quickly form groups (quartiles, deciles, etc) by ordering column(s) in a data frame线程中的方法。

这是我的代码:

as.numeric(cut(vector, breaks=quantile(vector, probs=seq(0,1, length  = 11), na.rm=TRUE),include.lowest=TRUE))

输出结果为:

 7  6  2  4  1  9  2 NA 10  3  9  7  4 10  5 NA  8  5 NA NA  1

正如我们所看到的,输出完全不同。我在这里错过了什么?我很感激任何想法。

这是ntile()函数中的错误吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:13)

dplyr::ntile NA总是最后(最高等级),这就是为什么在这种情况下你不会看到第10个十分位数。如果你想让十进制不考虑NA s,你可以定义一个函数,就像我接下来使用的here一样:

ntile_na <- function(x,n)
{
  notna <- !is.na(x)
  out <- rep(NA_real_,length(x))
  out[notna] <- ntile(x[notna],n)
  return(out)
}

ntile_na(vector, 10)
# [1]  6  6  2  4  1  9  2 NA  9  3  8  7  3 10  5 NA  8  5 NA NA  1

此外,quantile有9种计算分位数的方法,您使用默认值,即数字7(您可以检查?stats::quantile代表不同的type和{{ 3}}关于他们的讨论)。

如果您尝试

as.numeric(cut(vector, 
               breaks = quantile(vector, 
                                 probs = seq(0, 1, length = 11), 
                                 na.rm = TRUE,
                                 type = 2),
               include.lowest = TRUE))
# [1]  6  6  2  4  1  9  2 NA  9  3  8  7  3 10  5 NA  8  5 NA NA  1

您的结果与使用ntile的结果相同。

总结:它不是一个错误,只是它们的实现方式不同。