将shell环境变量传递给Rscript

Question

有没有办法将shell环境变量传递给Rscript。例如：

Rscript -e 'devtools::install_github("private/repo",auth_token = "$GITHUB_CRED")'

我试过这个，它只是传递了文字字符。我想知道是否还有另一种方式？

Answer 1

似乎有点荒谬，但是：

echo $GITHUB_CRED > file.txt
Rscript -e 'devtools::install_github("private/repo",auth_token = readLines("file.txt"))'

我在jenkins构建中使用这个和docker-slaves-plugin这样我就可以将所有配置存储在与我的软件包存储库相关联的Dockerfiles中（干净构建）

Answer 2

您是否尝试过使用Sys.getenv？

Rscript -e 'devtools::install_github("private/repo", auth_token=Sys.getenv("GITHUB_CRED"))'

Answer 3

在狭义的问题上：“是的，Rscript可以”：

edd@max:~$ SOME_VAR="some value" Rscript -e 'print(Sys.getenv("SOME_VAR"))'
[1] "some value"
edd@max:~$ 

至于处理GitHub凭据，可能通过适当的GitHub客户端提供更好的解决方案。您是否尝试过（优秀且推荐的）git2r包裹？