Question

我正在尝试创建一个动态时间扭曲（DTW）函数，它将计算提供给它的两个信号之间的最小距离。它基于以下算法

DTW算法： -

int DTWDistance(s: array [1..n], t: array [1..m]) {
    DTW := array [0..n, 0..m]

    w := abs(n-m)// adapt window size (*)

    for i := 0 to n
        for j:= 0 to m
            DTW[i, j] := infinity
    DTW[0, 0] := 0

    for i := 1 to n
        for j := max(1, i-w) to min(m, i+w)
            cost := d(s[i], t[j])
            DTW[i, j] := cost + minimum(DTW[i-1, j  ],    // insertion
                                        DTW[i, j-1],    // deletion
                                        DTW[i-1, j-1])    // match

    return DTW[n, m]

更多信息DTW Algorithm

现在我能够创建此算法的Octave函数并使其正常工作。

八度功能： -

function dtw_distance = dtw2(a,b)

length_a = length(a);
length_b = length(b);

an=zeros(length_a+1,length_b+1);
an(:,:)=9999;
an(1,1)=0;
cost=0;

#Here we have also implemented the window size.
w=abs(length_a-length_b);

for i=1:length_a
    for j=max(1,i-w):min(length_b,i+w)
        cost=abs(a(i)-b(j));
        an(i+1,j+1)=cost+min([an(i,j+1),an(i+1,j),an(i,j)]);
    end
end

an;
dtw_distance=an(length_a+1,length_b+1);

现在，随着参数大小的增加，此代码的计算时间也会增加。因此，我正在尝试创建用C ++编写的OCT文件，以便更快地执行。

C ++ OCT文件： -

#include <octave/oct.h>

octave_idx_type getMax(octave_idx_type a, octave_idx_type b){
    return (a>b)?a:b;
}

octave_idx_type getMin(octave_idx_type a, octave_idx_type b){
    return (a<b)?a:b;
}

DEFUN_DLD (dtw3, args, , "Find DTW of two Signals With Window")
{

int nargin = args.length();

if (nargin != 2)
    print_usage();
else
{

    NDArray A = args(0).array_value();
    NDArray B = args(1).array_value();

    octave_stdout << "Size of A is" << A.length();
    octave_stdout << "Size of B is" << B.length();

    if (! error_state)
    {
        octave_idx_type row = A.length()+1;
        octave_idx_type col = B.length()+1;

        Matrix results (row,col);

        for(octave_idx_type i = 0; i <= row ; i++)
        {
            for(octave_idx_type j=0; j<= col ; j++)
            {
                results(i,j)=9999;
            }
        }

        octave_stdout << "row col" << results.dim1() << results.dim2() ;
        octave_stdout << "row end" << results(row,0) ;
        octave_stdout << "col end" << results(0,col) ;

        results(0,0)=0;

        octave_idx_type win = (row>col)?(row-col):(col-row);

        octave_idx_type cost = 0;

        for(octave_idx_type i = 1 ; i <= row ; i++)
        {
            for(octave_idx_type j = getMax(1,i-win) ; j <= getMin(col,i+win) ; j++)
            {
                cost=(A(i)>B(j))?(A(i)-B(j)):(B(j)-A(i));
                results(i,j)= cost + getMin(getMin(results(i-1,j),results(i,j-1)),results(i-1,j-1));

            }
        }
        octave_stdout << "Ans is: " << results(row,col);
        return octave_value(results(row,col));
    }

}

}

示例输入/输出

输入 - Arg1：[1 2 3 4 5]，Arg2：[1 2 3 4 5 6 7]

输出

对于Octave函数： Ans是3

对于OCT FIle： * /usr/lib/x86_64-linux-gnu/octave/4.0.0/exec/x86_64-pc-linux-gnu/octave-gui': double free or corruption (!prev): 0x00007f24e81eb0a0 *** panic: Aborted -- stopping myself... *** Error in / usr / lib / x86_64-linux-gnu / octave / 4.0.0 / exec / x86_64-pc-linux-gnu / octave-gui'中的错误：malloc（）：内存损坏： 0x00007f24e81eb230 *
输入：Arg1：A = rand（1,221），Args2：B = rand（1,299）

输出：

对于Octave函数：Ans为72.63

对于OCT文件：

*`/usr/lib/x86_64-linux-gnu/octave/4.0.0/exec/x86_64-pc-linux-gnu/octave-gui'出错：双重免费或损坏（！prev）：0x00007f57a06ad940 * 恐慌：中止 - 阻止自己...... A的大小是2221的大小是2999格尔22220000 end9999col end9999Ans是：1试图将变量保存到'octave-workspace'... 保存到'octave-workspace'完成中止（核心倾销）

我的问题：

首先，我在使用OCT文件时遇到的双重免费损坏错误是什么？
Octave文件和OCT文件的答案有所不同，OCT文件中的错误是什么引起的？

谢谢。

Answer 1

首先，您应该阅读如何调试oct文件（http://wiki.octave.org/Debugging_Octave#Debugging_oct-files）

然后你会找到这个部分：

Matrix results (row,col);
for(octave_idx_type i = 0; i <= row ; i++)
{
    for(octave_idx_type j=0; j<= col ; j++)
    {
        results(i,j)=9999;
    }
}

Matrix结果有维度行col，但是你要写i<=row and j<=col超出边界1。试试i<row和j<col

你的代码中存在很多问题，这些问题太多了，无法描述，这里是我的更改。我已经取代了一些内置函数的函数：

#include <octave/oct.h>

DEFUN_DLD (dtw3, args, , "Find DTW of two signals with window")
{

  int nargin = args.length();

  if (nargin != 2)
    print_usage();

  Matrix A = args(0).array_value();
  Matrix B = args(1).array_value();

  octave_stdout << "Size of A is " << A.length() << std::endl;;
  octave_stdout << "Size of B is " << B.length() << std::endl;

  if (! error_state)
    {
      octave_idx_type n = A.length();
      octave_idx_type m = B.length();

      Matrix results (n + 1, m + 1);

      for(octave_idx_type i = 0; i <= n ; i++)
        for(octave_idx_type j = 0; j <= m ; j++)
          results(i, j) = octave_Inf;
      results(0, 0) = 0;

      octave_idx_type win = abs (n-m);

      double cost = 0;

      for(octave_idx_type i = 1 ; i <= n ; i++)
        for(octave_idx_type j = std::max(1, i-win) ; j <= std::min(m, i+win) ; j++)
          {
            cost = abs(A(i-1) - B(j-1));
            results(i, j) = cost + std::min(std::min(results(i-1,j),results(i,j-1)),results(i-1,j-1));
          }

      //octave_stdout << results << std::endl;
      return ovl(results(n, m));
    }
}

DTW算法OCT文件

1 个答案: