我有两个dask数组,即a和b。我得到a和b的点积,如下所示
>>>z2 = da.from_array(a.dot(b),chunks=1)
>>> z2
dask.array<from-ar..., shape=(3, 3), dtype=int32, chunksize=(1, 1)>
但是当我做的时候
sigmoid(z2)
Shell停止工作。我甚至无法杀死它。 Sigmoid如下:
def sigmoid(z):
return 1/(1+np.exp(-z))
答案 0 :(得分:2)
知道了......我尝试过它有效!
ans = z2.map_blocks(sigmoid)
答案 1 :(得分:2)
使用Dask Arrays时,通常最好使用dask.array
中提供的函数。直接使用NumPy函数的问题是它们会将数据从Dask数组拉入内存,这可能是您遇到的shell冻结的原因。 dask.array
中提供的功能旨在通过懒惰链接计算来避免这种情况,直到您希望对它们进行评估。在这种情况下,最好使用da.exp
代替np.exp
。提供了以下示例。
提供了代码的修改版本,以演示如何完成此操作。在示例中,我调用了.compute()
,它还将完整结果提取到内存中。如果您的数据非常大,这可能也会导致问题。因此,我已经演示了在调用compute之前获取一小部分数据以保持结果小且对内存友好。如果您的数据很大并且您希望保留完整的结果,则建议将其存储到磁盘中。
希望这有帮助。
In [1]: import dask.array as da
In [2]: def sigmoid(z):
...: return 1 / (1 + da.exp(-z))
...:
In [3]: d = da.random.uniform(-6, 6, (100, 110), chunks=(10, 11))
In [4]: ds = sigmoid(d)
In [5]: ds[:5, :6].compute()
Out[5]:
array([[ 0.0067856 , 0.31701817, 0.43301395, 0.23188129, 0.01530903,
0.34420555],
[ 0.24473798, 0.99594466, 0.9942868 , 0.9947099 , 0.98266004,
0.99717379],
[ 0.92617922, 0.17548207, 0.98363658, 0.01764361, 0.74843615,
0.04628735],
[ 0.99155315, 0.99447542, 0.99483032, 0.00380505, 0.0435369 ,
0.01208241],
[ 0.99640952, 0.99703901, 0.69332886, 0.97541982, 0.05356214,
0.1869447 ]])