knitr:添加图注

时间:2016-03-16 21:13:49

标签: r latex knitr figure subfigure

我的数字看起来像这样:

<<foo, fig.lp='', fig.cap='name', fig.subcap=c('left', 'right'),>>=
plot1
plot2
@

现在我想在下面显示关于此图的一组注释(即多行文本)。在knitr创建的图形环境中有没有方便的方法呢?

正如上面的评论中已经指出的,目前我的问题没有解决方案。我已提交功能请求。

3 个答案:

答案 0 :(得分:3)

我知道这是一个非常晚的答案,但这就是我最终为同一类型的问题所做的事情。

我定义了一个自定义钩子,可以根据需要绘制图像

# Custom knitr hook to add notes to the plot
knit_hooks$set(plot = function(x, options) {
  paste("\n\\end{kframe}\n\\begin{figure}\n",
        "\\includegraphics[width=\\maxwidth]{",
        opts_knit$get("base.url"), paste(x, collapse = "."),
        "}\n",
        "\\textsc{Note} -- here is some car stuff with notes",
        "\\caption{", options$fig.cap, "}\n",
        "\n\\end{figure}\n\\begin{kframe}\n",
        sep = '')
})

这是完整的.Rnw

\documentclass{article}

\usepackage[font=large,labelfont=sc]{caption}

\begin{document}

<<setup, echo=FALSE, message=FALSE, results='hide'>>=
suppressPackageStartupMessages({
  library(ggplot2)
})

opts_chunk$set(echo=FALSE)
opts_chunk$set(results="hide")
@

<<foo, fig.cap='with notes', fig.height=4, fig.width=6>>=
# save a regular plotting function
regular_plot <- knit_hooks$get("plot")

# Custom knitr hook to add notes to the plot
knit_hooks$set(plot = function(x, options) {
  paste("\n\\end{kframe}\n\\begin{figure}\n",
        "\\includegraphics[width=\\maxwidth]{",
        opts_knit$get("base.url"), paste(x, collapse = "."),
        "}\n",
        "\\textsc{Note} -- here is some car stuff with notes",
        "\\caption{", options$fig.cap, "}\n",
        "\n\\end{figure}\n\\begin{kframe}\n",
        sep = '')
})

ggplot(data = mtcars) + geom_point(aes(disp,mpg))
@

<<bar, fig.cap='without notes', fig.height=4, fig.width=6>>=
# restore regular plotting function
knit_hooks$set(plot = regular_plot)

ggplot(data = mtcars) + geom_point(aes(disp,mpg))
@

\end{document}

以下是生成的PDF:

enter image description here

答案 1 :(得分:2)

答案非常好!

我对Rmd进行了小小的修改,以首先获取标题并针对文档中的每个块进行概括。

我们必须在开头添加以下行:

knit_hooks$set(plot = function(x, options, .notes = notes, .sources = sources) {
  paste("\n\n\\begin{figure}\n",
        "\\includegraphics[width=\\maxwidth]{",
        opts_knit$get("base.url"), paste(x, collapse = "."),
        "}\n",
        "\\caption{",options$fig.cap,"}","\\label{fig:",opts_current$get("label"),"}","\\textsc{}",
        "\n\\textsc{Notas} -- ",.notes,
        "\n\\textsc{Fuentes} -- ", .sources,
        "\n\\end{figure}\n",
        sep = '')
})

然后在每个块中,我们只写出情节的注释和来源

notes = "Notes to explain the plot"
sources = "Explain the sources"

再次,非常感谢!

Pd:我使用"\\textsc{}"在标题,注释和来源之间生成一个空格。

最好将其概括为在同一图中使用带有多个图形的子标题。

答案 2 :(得分:0)

来自@akhmed的解决方案对我非常有帮助。我需要进行一些额外的自定义,我将其作为答案传递(对于评论来说太长了)。

  • 首先,我想要更多地控制音符的边距,并发现添加小型片环境有帮助(下面\\begin{minipage}设置为6英寸宽)。
  • 其次,我通过设置字体大小并左对齐文本(\\small\\begin{flushleft}下方)添加了几个次要的格式添加。

  • 最后,对于一些数字,我想使用fig.pos =&#34; h!&#34;或者数字位置=&#34;这里&#34; Knitr / Latex的选项,我花了一分钟才意识到这个钩子会覆盖那个chunk选项,所以我手动将它添加为\\begin{figure}[h!]

再次感谢@akhmed提供此解决方案。

knit_hooks$set(plot = function(x, options) {
    paste("\n\\end{kframe}\n\\begin{figure}[h!]\n",
      "\\includegraphics[width=\\maxwidth]{",
      opts_knit$get("base.url"), paste(x, collapse = "."),
      "}\n",
      "\\begin{minipage}{6in}\\small\\begin{flushleft}Note: Lorem ipsum \\end{flushleft}\\end{minipage}",
      "\\caption{", options$fig.cap, " \\label{", options$fig.lp, opts_current$get("label"), "}}\n",
      "\n\\end{figure}\n\\begin{kframe}\n",
      sep = '')
    })