使用RcppArmadillo进行矩阵乘法:为什么它不会更快?

时间:2016-03-16 16:28:56

标签: r rcpp matrix-multiplication

我正在尝试用RcppArmadillo做一些矩阵乘法。但是,我的代码显示使用RcppArmadillo 不会变得更快。

我正在使用Windows_10_Pro和R 3.2.4,以及RcppArmadillo 0.6.600.4.0

例如:

library(RcppArmadillo)
library(inline)

MCplus <- cxxfunction(signature(X_="numeric", Y_="numeric"),body ='
arma::mat X = Rcpp::as<arma::mat>(X_);
arma::mat Y = Rcpp::as<arma::mat>(Y_);
arma::mat ans = X * Y * X;
return(wrap(ans));
', plugin="RcppArmadillo")

A <- matrix(1:16000000,4000,4000)
C <- matrix(2:16000001,4000,4000)

R_M <- proc.time()
ans_R <- A%*%C%*%A # test with R
proc.time() - R_M

C_M <- proc.time()
ans_C <- MCplus(A,C) # test with RcppArmadillo
proc.time() - C_M

R输出:

user  system elapsed
106.75   0.24 106.98

RcppArmadillo输出:

user  system elapsed
108.28   0.23 108.56 

有什么可以改进吗?

提前致谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:6)

R本身将其归于LAPACK / BLAS - 链接到R的代码通过LAPACK / BLAS进行调用。所以,是的,两种方法都将运行相同的代码,差异只是由于开销很小。

有许多教程可以告诉您如何更改LAPACK库。这当然取决于操作系统。可以使用R Installation and Administration手册及其附录开始。