我正在尝试用RcppArmadillo做一些矩阵乘法。但是,我的代码显示使用RcppArmadillo 不会变得更快。
我正在使用Windows_10_Pro和R 3.2.4,以及RcppArmadillo 0.6.600.4.0
例如:
library(RcppArmadillo)
library(inline)
MCplus <- cxxfunction(signature(X_="numeric", Y_="numeric"),body ='
arma::mat X = Rcpp::as<arma::mat>(X_);
arma::mat Y = Rcpp::as<arma::mat>(Y_);
arma::mat ans = X * Y * X;
return(wrap(ans));
', plugin="RcppArmadillo")
A <- matrix(1:16000000,4000,4000)
C <- matrix(2:16000001,4000,4000)
R_M <- proc.time()
ans_R <- A%*%C%*%A # test with R
proc.time() - R_M
C_M <- proc.time()
ans_C <- MCplus(A,C) # test with RcppArmadillo
proc.time() - C_M
R输出:
user system elapsed
106.75 0.24 106.98
RcppArmadillo输出:
user system elapsed
108.28 0.23 108.56
有什么可以改进吗?
提前致谢!
答案 0 :(得分:6)
R本身将其归于LAPACK / BLAS - 链接到R的代码通过LAPACK / BLAS进行调用。所以,是的,两种方法都将运行相同的代码,差异只是由于开销很小。
有许多教程可以告诉您如何更改LAPACK库。这当然取决于操作系统。可以使用R Installation and Administration手册及其附录开始。