更改R中的列标题,使用交替的空格和名称(对于genalex格式)

时间:2016-01-02 23:13:11

标签: r replace dataframe names strsplit

我有一个名为genalex的数据框,因为我试图将我的遗传数据放入常见的#genalex"格式。我刚用R中的strsplit函数来拆分列,现在我有了这个:

> genalex[1:5,1:10]
  Ind V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9
1 100  A  A  C  C  N  N  C  C  N
2 101  A  A  C  C  N  N  N  N  N
3  10  A  A  C  C  N  N  C  C  N
4  11  A  A  N  N  N  N  C  C  N
5  12  N  N  N  N  N  N  C  C  G

此数据框实际上有330行和32,068列。我想用新名称替换每个其他列(V1,V3,V5,V7,V9等)的名称。我还想删除所有其他列名称(V2,V4,V6,V8等)

对于新列名,我想在分割列之前使用旧数据框中的列名。我将调用旧数据框table。此数据框有16,034列,因为它不包含空格:

 table[1:5,1:5]
    X X446043 X539052 X614054 X683054
1 100       A       C       N       C
2 101       A       C       N       N
3  10       A       C       N       C
4  11       A       N       N       C
5  12       N       N       N       C

因此,使用table中的旧列名,然后在每列之间添加空格,我最终希望我的数据框看起来像这样,对于所有32,068列:

   > genalex[1:5,1:8]
      Ind    X446043         X539052         X614054         X683054
    1 100    A       A       C       C       N       N       C  
    2 101    A       A       C       C       N       N       N  
    3  10    A       A       C       C       N       N       C  
    4  11    A       A       N       N       N       N       C  
    5  12    N       N       N       N       N       N       C  

感谢您的帮助。

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

您可以使用seq函数获取奇数和偶数位置:

names(genalex)[seq(2,ncol(genalex),2)] <- names(table)
names(genalex)[seq(1,ncol(genalex),2)] <- ""
names(genalex)[1] <- "Ind"

第一行使用表中的列名重命名所有偶数列索引(2,4,6,...),第二行将所有奇数列索引设置为空白。然后将第一列重命名为&#34; Ind&#34;。