我有一个代码,我想使用OpenMP进行并行化。该程序演示了一个执行多项式插值的函数。首先,我想到在代码中的许多函数之一内并行化一个for循环。这个的串行版本是这样的:
void polint (double xa[], double ya[], int n, double x, double *y, double *dy) {
int i, m, ns=1;
double den,dif,dift,ho,hp,w;
double *c, *d;
dif = fabs(x-xa[1]); c = vector(1,n);
d = vector(1,n); for (i=1; i<= n; i++) {
dift = fabs (x - xa[i]);
if (dift<dif) {
ns = i;
dif = dift;
}
c[i] = ya[i];
d[i] = ya[i];
}
*y = ya[ns--];
for (m = 1; m < n; m++) {
for (i = 1; i<= n-m; i++) {
ho = xa[i] - x;
hp = xa[i+m] - x;
w = c[i+1] - d[i]; den = ho - hp;
den = w / den; d[i] = hp * den; c[i] = ho * den;
}
*y += (*dy=(2*ns < (n-m) ? c[ns+1] : d[ns--]));
}
free_vector (d, 1, n); free_vector (c, 1, n);
}
现在,使用OpenMP,我构建了这段代码:
void polint (double xa[], double ya[], int n, double x, double *y, double *dy) {
int i, m, ns=1;
double den,dif,dift,ho,hp,w;
double *c, *d;
int nth;
dif = fabs(x-xa[1]); c = vector(1,n);
d = vector(1,n); for (i=1; i<= n; i++) {
dift = fabs (x - xa[i]);
if (dift<dif) {
ns = i;
dif = dift;
}
c[i] = ya[i];
d[i] = ya[i];
}
#pragma omp parallel
{
*y = ya[ns--];
nth = omp_get_num_threads();
for (m = 1; m < n; m++) {
#pragma omp for
for (i = 1; i<= n-m; i++) {
#pragma omp critical
{
ho = xa[i] - x;
hp = xa[i+m] - x;
w = c[i+1] - d[i]; den = ho - hp;
den = w / den; d[i] = hp * den; c[i] = ho * den;
}
}
#pragma omp critical
*y += (*dy=(2*ns < (n-m) ? c[ns+1] : d[ns--]));
}
free_vector (d, 1, n); free_vector (c, 1, n);
}
}
程序编译正确,但问题来自于我运行它。我收到以下错误消息:
我该如何解决这个问题?我首先想到的是数组被超越,所以我添加了关键区域,以便许多进程不会同时访问数组。但是,这并没有解决问题。 提前谢谢!
答案 0 :(得分:3)
除了显而易见的c
和d
指针释放产生你遇到的崩溃之外,你的代码中还有很多问题。为了更好地指出它们,我用更合理的变量声明和正确的缩进重写了顺序函数。以下是它给我的信息:
void polint( double xa[], double ya[], int n, double x, double *y, double *dy ) {
double *c = vector( 1, n );
double *d = vector( 1, n );
double dif = fabs( x - xa[1] );
int ns = 1;
for ( int i = 1; i <= n; i++ ) {
double dift = fabs( x - xa[i] );
if ( dift < dif ) {
ns = i;
dif = dift;
}
c[i] = ya[i];
d[i] = ya[i];
}
*y = ya[ns--];
for ( int m = 1; m < n; m++ ) {
for ( int i = 1; i <= n - m; i++ ) {
double ho = xa[i] - x;
double hp = xa[i + m] - x;
double den = ( c[i + 1] - d[i] ) / ( ho - hp );
d[i] = hp * den;
c[i] = ho * den;
}
*dy = 2 * ns < ( n - m ) ? c[ns + 1] : d[ns--];
*y += *dy;
}
free_vector( d, 1, n );
free_vector( c, 1, n );
}
现在,阅读代码变得更简单了(虽然它仍然非常模糊)并且一些问题变得明显:
1
索引到n
而不是从0
到n-1
?如果是这样,这是不寻常的(并且容易出错)。如果没有,你的循环中可能会出现一些问题(尤其是第一个i
循环)。dy
的值在m
循环的每次迭代中重写。知道这是一个输出参数,这意味着它的最终值只是与m
的最后一个值相对应的值。这不是一个问题,但它看起来很可疑......你确定它是正确的吗?den
的定义和c
c[i]
的后续更新看出c[i+1]
取决于private
。从并行化的角度来看,这是一个大问题。这意味着现在编写代码的方式,它无法并行化。这并没有完全关闭并行化的大门,但这只是意味着还有更多的工作要做,而不仅仅是使用一些OpenMP指令来实现它。现在,除了这些问题之外,如果我们看一下您的并行版本,还有很多其他问题:
m
应该包含的数据:至少ho
,hp
,w
,den
和{{ 1}}应该声明private
。此外,我强烈怀疑*y
应该声明reduction(+)
而*dy
应该声明lastprivate
(尽管正确执行此操作的确切方法需要更精细的调整)。< / LI>
private
声明的缺失,您将并行循环的整个主体包含在critical
区域中,基本上将其重新序列化。不幸的是,它既是超感染又是错误的,因为正如我们所看到的,迭代的顺序很重要,而这并不能保留它...... 总而言之,我强烈建议你做一些事情:
i
的{{1}}依赖关系。这可以通过保留它的两个副本(一个对应于c
循环的上一次迭代中的值,一个对应于其当前值)来轻松完成。m
等。好消息是,如果你按照我的建议做了并尽可能地延迟了他们的声明,那么你很可能很少需要照顾,因为大多数声明都在private
区域内,做出相应的变量应该自动parallel
。有了这个,您应该能够获得正确且(希望)有效的代码并行版本。