MATLAB：在while循环中使用parfor（并行for循环）是否效率低下。

Question

我在做MCMC（Monte Carlo Markov Chain）时遇到了麻烦。所以对于MCMC来说，我会运行10000次迭代，然后在每次迭代中，我将绘制一些参数。但是在每次迭代中，我都有一些独立的个人数据，所以我可以做parfor。然而，问题是，当MCMC继续时，似乎完成一次迭代的时间会迅速增长。很快，它非常耗时。 我的问题是：是否有任何有效的方法来结合parfor和while循环？

我有以下伪代码：

r=1;
while r<10000
parfor i=1:I
  make draws from proposal distribution 
  calculate acceptance rate  
  accept or reject current draw
end

r=r+1;
end

Answer 1

如果每个循环持续时间很短，则启动大量单独的parfor循环可能效率低下。不幸的是，正如您可能知道的那样，您不能break循环parfor。一种替代方案可能是使用parfeval。这个想法是进行许多parfeval次调用（但不是太多），然后当你有足够的结果时你可以终止。

This (fairly long) blog article显示了在您可能希望提前终止计算的情况下使用parfeval的示例。