我是GWAS分析的新手，我一直试图在gPLINK上运行PLINK教程样本数据集（hapmap 80K loci）来做一些排除。我目前正在开发Mac OSX 10.10。我已经将阈值设置（高丢失率，低MAF等）应用到我的文件“hapmap1.ped”并准备通过gPLINK执行命令，但它不断给我错误提示“无法在本地执行命令”。
我的库或目录设置有问题吗？
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gPlink以远程模式和本地模式两种模式运行。看来你正在运行本地的。在配置gPlink时，请检查您是否指定了安装PLINK的正确路径。有关详细信息，请参阅gPlink configuration