MRT功能[1]"错误代码= 0"

时间:2015-07-01 18:04:08

标签: multivariate-testing

当我完成MRT时,我遇到了两个错误:

  

[1]"错误代码= 0"和indval.default中的错误(Ynode,clustering =   clustnode,numitr = 1000):所有物种必须至少出现一次   情节。有谁知道为什么?我检查了所有的物种   有丰富的> 0 ...

MRTtest=mvpart(vegetation~ Placette+ Tourb + Transect + Largcanal + Annouvert + Elevation + Profnappe + Litiere+ Solnu+ Deblign+ Densiometre+ EpaissMO+ Vonpostvingt+ Vonpostsoixante+ Pyrovingt+ Pyrosoixante+ Sommesurfterr,tot,margin=0.08,cp=0,xv="pick",xval=10,xvmult=150,which=4,pca=F)
  

X-Val代表:1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17   18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35   36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53   54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71   72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89   90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105   106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119   120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133   134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147   148 149 150

最小树大小 tabmins   2 3 4 6   2 125 5 18

  

MRTtest1 = MRT(MRTtest,百分比= 10,物种= colnames(植被))   摘要(MRTtest1)   物种为每个特定节点解释的偏差部分(%)

~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ~~~~~~~                     ---节点1 ---  复杂性(R2)14.87422  Sommesurfterr> = 6.024 Sommesurfterr< 6.024

〜判别物种:                        THOnmtot THOmtot 爆炸的百分比。 deviance 17.61057298 38.419650816 意思是左边0.37621604 0.430818462 意思是右边0.08877576 0.006259911 [1]"错误代码= 0"

〜此节点的INDVAL种类::左边是1,右边是2          cluster indicator_value probability THOmtot 1 0.9597 0.001 THOnmtot 1 0.7878 0.001 LEG 1 0.5802 0.031 LIB 1 0.5078 0.010 MELnmtot 1 0.4710 0.047 EPNnmtot 1 0.4404 0.026

概率总和= 87.497

指标值总和= 30.02

重要指标值之和= 12.67

重要指标数量= 29

重要指标分布

1 2  8 21

~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ ~~~~~~~                     ---节点2 ---      复杂性(R2)7.920283      Densiometre< 19.88 Densiometre> = 19.88

~ Discriminant species : 
                            TRA    THOmtot
% of expl. deviance 10.54536819 27.8848051
Mean on the left     0.02754503  0.5158733
Mean on the right    0.20823621  0.2220475
  

indval.default出错(Ynode,clustering = clustnode,numitr = 1000)   :所有物种必须至少出现在一个地块

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