d3可视化数据的最佳实践？

Question

我正在开发一个项目，使用d3在散点图中显示数据点。由于它是一个Web应用程序，该区域是有限的，并且许多点重叠。总共有20k点，我允许用户使用画笔（及其范围）放大区域，但即使放大，仍然存在大量的点重叠。这种情况的一个例子：

有什么好方法可以使基础点可视化，增强观点或对点数的感知？我在考虑使用透明度，但我不知道是否会这样做。

值得注意的是，所有点都代表基因，因此将它们聚类在表示方面可能不是很合理。

Answer 1

如果感兴趣的是数据点的数量，那么您可以群集点（在客户端/服务器端）。如果地图有太多标记（example cluster map），您通常会看到此模式。

修改：

我仍然不确定我是否正朝着正确的方向前进。要可视化点的数量，您可以使用3D可视化。以下是Software Cities项目的想法：

你基本上可以渲染平面上点的位置并创建垂直圆柱 - 同一点上的点越多，圆柱越高。

Answer 2

我建议尝试d3＆＃39; Waiting till button is pressed。它允许您使用鼠标缩放和扭曲比例，让您放大区域。

您可以在此处看到与页面下方的散点图/气泡图一起使用的示例：fisheye plug-in

此外，如果你有重叠，我会增加不透明度，所以你可以看到哪些点有很多重叠而不是点。

这是我使用鱼眼和不透明度创建的非常聚集点的示例图：http://bost.ocks.org/mike/fisheye/

它还允许您将鼠标悬停在各个点上，以查看包含有关它们的更多详细信息的工具提示。