Gephi 0.8.2中的聚类

时间:2015-05-20 19:35:51

标签: cluster-analysis social-networking gephi sna

我正在使用Gephi中的数据集,该数据集来自Buddypress网站的朋友表。我已经使用内置功能对图表做了很多工作,但是对于比包含的更好的聚类算法感兴趣(我使用Force Atlas 2来安排节点)。例如,我想使用我的模块化属性将节点分组到集群中。我尝试下载两个插件(Girvan Newman和Markov聚类算法),但无法弄清楚如何将它们应用到我的图形中。它们出现在"集群"工作流程上的窗口,但是当我选择它们时,"运行"按钮显示为灰色。他们也没有出现在"插件"下拉主UI。有什么想法吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

这有点棘手。 Girvan-Newman也让我感到灰暗,但在一些Gephi重启后,我设法让它运转起来。我认为最好的想法是关闭Gephi,然后从文件系统打开你的.gephi文件,Gephi仍然关闭。

如果你无法运行算法,那么尝试从统计学中计算出图形Modularity,它将Louvain社区检测方法应用于你的图形。在模块化或Girvan-Newman运行之后,它们为每个节点分配一个簇号,它是它们所属的簇

然后,您可以为图表着色,以指示具有单独颜色的各种不同分区。这是通过Gephi中的 Partition 窗口完成的。

The partition window in Gephi, where partitioning based on modularity class is selected

然后,您可以运行 Force Atlas 2 来相应地布局群集。