rowSums(x)中的错误:'x'必须是至少两个维度的数组(素食主义者:oecosimu)

时间:2015-05-11 16:14:55

标签: arrays r bipartite vegan

我正在尝试在素食包中使用oecosimu应用程序。

library(sna)
 library(permute)
library(lattice)
library(vegan)
library(bipartite)
bio<-read.csv("/home/vicar66/Raw_data/Jan12/98percents_April_16/otu_table/Chapter1/no_bloom_bio_data_L3.txt")
rownames(bio)<-bio[,1]
bio[,1]<-NULL
bio_m<-as.matrix(bio)
a<-oecosimu(bio_m,bipartite::C.score,"swap")

但我一直有这样的错误消息: 附上包裹:'bipartite'

以下对象从'package:vegan'屏蔽:

nullmodel

rowSums(x)中的错误:'x'必须是至少包含两个维度的数组 电话:oecosimu - &gt; nullmodel - &gt; rowSums 执行暂停

演示数据:

    Ciliophora  Dinoflagellates MALVs   Choanoflagellida
DNAHIN5m    0.062469804 0.826323018 0.031084701 0.000323747
DNAHIN35m   0.045216826 0.595750636 0.187010719 0.000917053
DNAHIN150m  0.018434224 0.204865296 0.531016032 0.017009618
DNAHIN240m  0.016211333 0.889640227 0.04191846  0.03087407

**第一列第一行为空。第一行是rownames

有人遇到过这个问题吗?

谢谢!

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