使用R shiny上传后编辑数据框

时间:2015-01-09 13:39:57

标签: r shiny edit import-from-csv

我构建了一个闪亮的应用程序,它接受用户上传的CSV文件并添加标题 以及几个新专栏,以便事后进行一些计算。

上传的CSV文件包含2列,如下所示:

1  0.21
1  0.20
1  0.23
2  0.40
2  0.42
2 ...

要上传文件我使用此代码(正在运行):

data1<- reactive({
    inFile <- input$file1
    if(is.null(inFile)){return()}
    data1<- read.csv(file=inFile$datapath,header =input$header,sep=input$sep)
})

下一步是将标题添加到这两列,并以这种方式添加另外两列:

Dose  Response SquareRoot    Log  
1     0.21     sq(Response)  log(Response)
1     0.20     ...           ...
1     0.23     ...           ...
2     0.40     ...           ...
2     0.42     ...           ...
2 ...

在R会话中,我将使用的代码是:

  data1<- read.csv(file=inFile$datapath,header =input$header,sep=input$sep)
  colnames(data1) <-c("Dose","Response")
  data1$ResponseLog <- log10(data1$Response + 1)
  data1$ResponseSqRoot <- sqrt(data1$Response + 1)

如果我这样做有光泽地将这些行添加到我的Rshiny应用程序中它将无法正常工作并给我错误: 错误:长度为0的参数,即使我只使用colnames()定义列名。

所以我的问题是,有没有办法编辑我刚上传的数据帧?我已经问过这个问题你能不能重定向我,因为我找不到解决办法。 我希望我能给你足够的细节来理解这个问题。

1 个答案:

答案 0 :(得分:7)

希望这会有所帮助:我也添加了一个按钮

rm(list = ls())
library(shiny)

ui = fluidPage(
    sidebarPanel(
      fileInput('file1', 'Choose file to upload',accept = c('text/csv','text/comma-separated-values','text/tab-separated-values','text/plain','.csv','.tsv')),
      checkboxInput('header', 'Header', TRUE),
      radioButtons('sep', 'Separator',c(Comma=',',Semicolon=';',Tab='\t'),'Comma'),
      radioButtons('quote', 'Quote',c(None='','Double Quote'='"','Single Quote'="'"),'Double Quote'),
      actionButton("Load", "Load the File"),width = 3),
    mainPanel(tableOutput("my_output_data"))
)

server = function(input, output) {

  data1 <- reactive({
    if(input$Load == 0){return()}
    inFile <- input$file1
    if (is.null(inFile)){return(NULL)}

    isolate({ 
    input$Load
    my_data <- read.csv(inFile$datapath, header = input$header,sep = input$sep, quote = input$quote,stringsAsFactors =FALSE)
    colnames(my_data) <-c("Dose","Response")
    my_data$ResponseLog <- log10(my_data$Response + 1)
    my_data$ResponseSqRoot <- sqrt(my_data$Response + 1)
    })
    my_data
  })
  output$my_output_data <- renderTable({data1()},include.rownames=FALSE)  

}
runApp(list(ui = ui, server = server))