Question

我正在尝试在一个bash脚本中执行三个任务。

我所做的编码是：

#!/bin/bash

(cd TRAJ_OctylGlcTryp_C1/
&&
cpptraj zOctylgluTryC1.prmtop << EOF
trajin reImaged-OctylgluTryC1.nc 1 70000 500
trajout reImaged-OctylgluTryC1-500.nc netcdf
EOF 
&& 
cd ../)

这意味着，首先进入目录TRAJ_OctylGlcTryp_C1并选择几帧模拟数据，最后退出文件夹。

但是我得到这样的错误

./run_Select500Frames.sh: line 4: syntax error near unexpected token `&&'
./run_Select500Frames.sh: line 4: `&& '

有没有办法摆脱这个错误？感谢。

Answer 1

你可以这样简单地写出来：

#!/bin/bash

set -eu

pushd TRAJ_OctylGlcTryp_C1/ > /dev/null

cpptraj zOctylgluTryC1.prmtop << EOF
trajin reImaged-OctylgluTryC1.nc 1 70000 500
trajout reImaged-OctylgluTryC1-500.nc netcdf
EOF

popd > /dev/null

我建议总是使用新的Bash脚本顶部的set -eu。这样，如果命令失败，脚本将自行停止。从那里开始，我选择使用pushd和popd作为最后恢复旧工作目录的更可靠的方法，其余的很容易。完全没有&&。

一个bash脚本中的多个任务

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