通过应用对数差异来计算增长率

时间:2010-04-16 08:05:13

标签: optimization r logging transformation

我试图通过计算每列的log-differences来转换我的data.frame 并控制行id。所以基本上我喜欢计算每个id变量的增长率。 所以这里是一个带有id列的随机df,一个时间段colum p和三个变量列:

df <- data.frame (id = c("a","a","a","c","c","d","d","d","d","d"),
                  p = c(1,2,3,1,2,1,2,3,4,5),
                  var1 = rnorm(10, 5),
                  var2 = rnorm(10, 5),
                  var3 = rnorm(10, 5)
                  )
df
     id p     var1     var2     var3
1     a 1 5.375797 4.110324 5.773473
2     a 2 4.574700 6.541862 6.116153
3     a 3 3.029428 4.931924 5.631847
4     c 1 5.375855 4.181034 5.756510
5     c 2 5.067131 6.053009 6.746442
6     d 1 3.846438 4.515268 6.920389
7     d 2 4.910792 5.525340 4.625942
8     d 3 6.410238 5.138040 7.404533
9     d 4 4.637469 3.522542 3.661668
10    d 5 5.519138 4.599829 5.566892

现在我已经编写了一个功能,它完全符合我的要求,但我不得不绕道而行,这可能是不必要的,可以删除。但是,不知怎的,我无法找到 捷径。 以下是发布数据框的功能和输出:

fct.logDiff <- function (df) {
df.log <- dlply (df, "code", function(x) data.frame (p = x$p, log(x[, -c(1,2)])))
list.nalog <- llply (df.log, function(x) data.frame (p = x$p, rbind(NA, sapply(x[,-1], diff))))
ldply (list.nalog, data.frame)
}

 fct.logDiff(df)
     id p        var1        var2        var3
1     a 1          NA          NA          NA
2     a 2 -0.16136569  0.46472004  0.05765945
3     a 3 -0.41216720 -0.28249264 -0.08249587
4     c 1          NA          NA          NA
5     c 2 -0.05914281  0.36999681  0.15868378
6     d 1          NA          NA          NA
7     d 2  0.24428771  0.20188025 -0.40279188
8     d 3  0.26646102 -0.07267311  0.47041227
9     d 4 -0.32372771 -0.37748866 -0.70417351
10    d 5  0.17405309  0.26683625  0.41891802

问题是由于添加了NA - 行。我不想折叠帧并减少它,这将由diff()函数自动完成。所以我在原始帧中有10行,并且在转换后保持相同数量的行。为了保持相同的长度,我必须添加一些NAs。我通过将data.frame转换为列表来绕道而行,将NAs添加到每个id的第一行,然后将列表转换回data.frame。这看起来很单调乏味。

任何避免data.frame-list-data.frame类转换并优化函数的想法?

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

这个怎么样?

nadiff <- function(x, ...) c(NA, diff(x, ...))
ddply(df, "code", colwise(nadiff, c("var1", "var2", "var3")))