R2WinBUGS打开WinBUGS窗口,但不启动模拟

时间:2014-10-14 13:29:53

标签: r windows-7-x64 winbugs r2winbugs

我正在尝试使用在Windows 7中运行的R和R2WinBUGS在WinBUGS中运行一些模拟。

在我准备好所有文件并启动函数bugs()之后,WinBUGS窗口会打开,但不会启动模拟。旧版R和OpenBUGS也是如此。这是Windows的问题吗?

以下是代码:

N <- 1000 #Number of simulations

S <- 100 #Number of sites

Phi <- .4 # Occupancy probability

Occ <- array(NA, dim=c(N, S))

for (n in 1:N){
    Occ[n,] <- rbinom(S, 1, Phi)
}

# Model
sink("W.txt") 
cat("
model {
# priors
psi ~ dunif(0, 5)

#Model
for (i in 1:nsite) {

    #Ocupation model
    Z[i] ~ dbern(psi)
}

}# end of model
",fill = TRUE)
sink()

library(R2WinBUGS)

# MCMC settings
ni <- 1000
nt <- 5
nb <- 500
nc <- 5

# Parameters monitored
params <- c("psi")

#Bundle data
data <- list(Z=Occ[1,])

#Initial values
inits <- function(){list(psi =runif(1, 0, 5))}

#Lunch WinBUGS
Bugs <- bugs(data, inits, params, "W.txt", n.chains = nc, n.thin = nt, n.iter = ni, n.burnin = nb, debug=T, working.directory = getwd(), save.history=T)

print(Bugs, dig=3)

任何帮助将不胜感激! 干杯 马里奥

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

我已经发现了什么导致错误。

我的工作目录是:

"E:\\Sim's"

似乎WinBUGS不适用于带撇号的地址。我已将其更改为:

"E:\\Sims"

它完美无缺。

感谢。

干杯! 马里奥