Question

我在加载BioConductor包“GO.db”时遇到问题。它失败并出现错误：

错误：.onLoad在'GO.db'的loadNamespace（）中失败，详情：
call：sqliteNewConnection（drv，...）错误：RS-DBI驱动程序:(不能连接到dbname：无法打开数据库文件）错误：包或 “GO.db”
的命名空间加载失败

我在Windows 8中工作，使用R 3.1.0和Bioconductor 2.14（最新版本）。

请帮忙。

完整数据：

R版本3.1.0（2014-04-10） - “春之舞”版权所有（C）2014   R统计计算平台基金会：   x86_64-w64-mingw32 / x64（64位）

R是免费软件，绝对免费保修。你是   欢迎在某些条件下重新分发。输入'license（）'   或'license（）'以获取分发详情。

R是一个与许多贡献者合作的项目。类型   'contributors（）'获取更多信息，'引用（）'如何引用   出版物中的R或R包。

为某些演示输入'demo（）'，为在线帮助键入'help（）'，或者   'help.start（）'为HTML浏览器界面提供帮助。输入'q（）'即可   退出R。

[以前保存的工作区已恢复]


source（“http://bioconductor.org/biocLite.R”）Bioconductor版本2.14（BiocInstaller 1.14.2），？biocLite寻求帮助     biocLite（“GO.db”）BioC_mirror：http://bioconductor.org使用Bioconductor版本2.14（BiocInstaller 1.14.2），R版本       3.1.0。安装包'GO.db'尝试网址'http://bioconductor.org/packages/2.14/data/annotation/bin/windows/contrib/3.1/GO.db_2.14.0.zip'     内容类型'application / zip'长度为27089981字节（25.8 Mb）     URL已下载25.8 Mb


下载的二进制包在           C：\ Users \用户קובי\应用程序数据\本地\ TEMP \ RtmpCGiNBg \ downloaded_packages


library（“GO.db”）加载必需的包：AnnotationDbi加载必需的包：BiocGenerics加载所需的包：parallel


附加包装：'BiocGenerics'

以下对象从'package：parallel'屏蔽：
clusterApply, clusterApplyLB, clusterCall, clusterEvalQ,
clusterExport, clusterMap, parApply, parCapply, parLapply,
parLapplyLB, parRapply, parSapply, parSapplyLB
以下对象从'package：stats'屏蔽：
xtabs
以下对象从'package：base'屏蔽：
anyDuplicated, append, as.data.frame, as.vector, cbind, colnames,
do.call, duplicated, eval, evalq, Filter, Find, get, intersect,
is.unsorted, lapply, Map, mapply, match, mget, order, paste, pmax,
pmax.int, pmin, pmin.int, Position, rank, rbind, Reduce, rep.int,
rownames, sapply, setdiff, sort, table, tapply, union, unique,
unlist
加载必需的包装：Biobase欢迎使用Bioconductor
Vignettes contain introductory material; view with
'browseVignettes()'. To cite Bioconductor, see
'citation("Biobase")', and for packages 'citation("pkgname")'.
加载必需的包：GenomeInfoDb加载所需的包：DBI   错误：.onLoad在'GO.db'的loadNamespace（）中失败，详情：
  call：sqliteNewConnection（drv，...）错误：RS-DBI驱动程序:(不能   连接到dbname：无法打开数据库文件）错误：包或   “GO.db”
的命名空间加载失败

Answer 1

我有同样的问题。尝试将R重新安装到另一个目录（另一个光盘）。它帮助了我。

加载BioConductor库“GO.db”失败

1 个答案: