R中的多个箱图,同时按列和行对矩阵进行分组

时间:2013-07-09 14:53:06

标签: r boxplot

我无法弄清楚如何在R中制作包含多个箱图的单个图形,同时按列和行对数据框/矩阵进行分组。

我在R中有一个包含10行和500列的数据框。这些列分为两组(因子 - 1和2),现在我想要一个包含两个箱图的单个图,该数据框对应于列组的数据框的每一行。

实施例

    M1 N2 O1 P2 Q1 R2      # [The 1's and 2's refer to my two column groups]
 A  10 11 12 13 14 15
 B  15 14 13 12 11 10 
 C  20 21 22 23 24 25
 D  25 24 23 22 21 20

因此,对于上面的例子,我希望每行有一个带有“4个箱图对”的图,这样每个箱图对将代表对应于我的列的1和2因子的值。

先谢谢!!!

1 个答案:

答案 0 :(得分:6)

使用reshape2的想法。由于列数多于行数,因此自然可以使用转置。

library(ggplot2)
library(reshape2)
dt <- read.table(text='
M1 N2 O1 P2 Q1 R2     
A  10 11 12 13 14 15
B  15 14 13 12 11 10 
C  20 21 22 23 24 25
D  25 24 23 22 21 20',header=TRUE)
dt.m <- melt(t(dt))
dt.m$Var1 <- gsub('[A-Z]','',dt.m$Var1)

这里有两个选项:

library(ggplot2)
library(gridExtra)
p1 <- ggplot(dt.m) +
   geom_boxplot(aes(x=Var2,y=value,fill=Var1))

p2 <- ggplot(dt.m) +
  geom_boxplot(aes(x=Var2,y=value,fill=Var2))+
  facet_grid(~Var1)

grid.arrange(p1,p2)

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