未找到SGE命令，未定义的变量

Question

我正在尝试设置新的计算群集，并且当前在SGE中使用qsub命令时遇到错误。这是一个简单的实验，显示了问题：

test.sh

#!/usr/bin/zsh

test="hello"
echo "${test}"

test.sh.eXX

  

test = hello：找不到命令。

     

测试：未定义的变量。

test.sh.oXX

  

警告：无权访问tty（错误的文件描述符）。

     

因此在这个shell中没有作业控制。

如果我在头节点上运行脚本（sh test.sh），则输出正确。我通过输入“qsub test.sh”将作业提交给SGE。

如果我在已建立的计算群集（如HPC）上以相同的方式提交完全相同的脚本作业，则可以按预期完美地运行。什么设置可能导致此问题？

感谢您对此事的任何帮助。

Answer 1

群集上的队列很可能设置为posix_compliant模式，默认shell为/ bin / csh。 posix_compliant设置意味着你的＃！线被忽略。您可以将队列更改为unix_behavior，也可以使用qsub的-S选项指定所需的shell。

#$ -S /bin/sh