在Python中绘制聚类图

Question

我已经有了一种聚类图形的方法，因此聚类过程不是问题所在。我想要做的是，一旦我们将所有节点聚集在一起 - 用Python绘制聚类图，就像这样：

我查看了networkx，igraph和graph-tool，但它们似乎进行了聚类，但不是绘图。我应该使用什么库来绘制已经聚集的图形的任何想法和命题，这将最大限度地减少交叉链接的数量？

Answer 1

看看GraphViz http://www.graphviz.org/Gallery/directed/cluster.html 有一个Python绑定，但我不得不说我总是直接创建文本文件，因为它们很容易编写。不要被看似简单的例子所迷惑，图表的每个方面都是高度可定制的，你可以用它做一些非常漂亮的图形可视化。虽然不确定嵌套集群，但从未尝试过。