我对cassandra及其数据模型相对较新。我有一大堆数据，由染色体上的位置（染色体：起始端）描述，其中我们有24条染色体，起点和终点是整数。我想支持的查询是找到基因组中与一组其他位置重叠的所有位置。如果没有其他想法，我可以创建一个简单的基于R树的“索引”方案，但我认为有人可能会遇到这个问题并提出解决方案。
答案 0 :(得分：1)
由于您需要查询2个维度，您可以使用支持这类geospacial indexing/queries的其他数据库，例如mongodb，请参阅Bounds Queries
在Cassandra，我认为你能做的最好的就是使用geocell（doc）或其他空间填充曲线
您将为每个数据转换开始和结束为geohash，然后您将能够搜索边界框，在[s1，s2]中开始并在[e1，e2]中搜索，通过搜索geohash（s1，e1）和geohash（s2，e2）之间的geocells，它们在bouding框中提供连续的位置